ユーザーのファイルとシステムファイルを分離する上で、設定した方が良いパスを指定する環境変数です。

テンプレートの編集画面で「ファイルへのリンク」を指定した場合の、リンクするファイルが格納されるディレクトリを指定します。

指定がない場合、環境変数 UserTemplatePath が使用されていればそちらを利用します。UserTemplatePath の指定もなければ、Movable Type アプリケーションがインストールされたディレクトリの直下が格納場所として使用されます。